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ふるさと納税の寄付金証明書（紙）
税務署には、証明書を郵送する必要はなく、PDFにして送信するようなことも不要です。「提出省略」という扱いです。
後日、税務署から確認を求めることがあり得るので、7年？は保管しておくように、と書かれていた気がします。
抜き打ちチェックは滅多にないだろうとか考えて嘘申告しても、嘘はバレます。その嘘、犯罪です。国税局は何も言っていませんが、システム上は自治体からの実績データと突合せれば、嘘申告を探すことが可能です。
税務署に送信したデータ（dataファイル、xmlファイル）
確定申告の最終シーンで、「保存しておきましょう」と誘導されますので、保存します。
来年の申告では、このデータを読み込んでから、申告を開始します。
ふるさと納税だけであれば失くしても大きな被害はありませんが、損失の計上を行っている人は失くすと少々面倒です。
税務署に送信した確定申告内容（PDFファイル）
自分の確認用です。
誰かに渡す目的ではありません。
利用者識別番号ほか、番号やパスワードのメモ（ノート）
前述の通り。